El día 12 de julio del año 2005, empezó un incendio que acabó con toda una sección del hospital, la cual no tenia ningun tipo de sistema contra incendios. Dicha
sección está ubicada en el sector nordeste del complejo hospitalario.
Era de las partes más antiguas del hospital y databa del año 1943.
En el 2005 los costarricenses presenciamos uno de los incendios mas desgarradores del Seguro Social a manos de un mismo empleado de la Institución, queda en manifiesto la debilidad de los empleadores a la hora de contratar el recurso humano, así como la vulnerabilidad de los centros hospitalarios a la hora de enfrentar un siniestro de esas magnitudes, dicha emergencia se debió a varias causas de las cuales destacaremos las mas importantes: problemas de insatisfacción del recurso humano así como problemas psicosociales, ningún tipo de sistema contra incendios, pésima ubicación y mantenimiento de extintores, cero capacitación al personal no existía brigadas de emergencia y el edificio era muy viejo y las instalaciones no cumplían con la normativa